Платёжные системы и банки могут брать комиссию за пополнение, вывод и конвертацию. Если счёт и карта в разных валютах, добавляется курсовая разница.
Как проверить: перед операцией посмотрите условия конторы и платёжной системы, найдите итоговую сумму после комиссии. В учёте записывайте фактическую сумму, а не заявленную.